Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN2BO60939 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN2BO60939 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN2BO60939 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms