Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNASEH1O60930 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNASEH1O60930 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNASEH1O60930 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNASEH1O60930 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms