Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRD4O60885 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRD4O60885 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRD4O60885 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRD4O60885 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRD4O60885 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRD4O60885 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRD4O60885 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRD4O60885 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRD4O60885 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRD4O60885 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRD4O60885 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRD4O60885 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BRD4O60885 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRD4O60885 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRD4O60885 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRD4O60885 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRD4O60885 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRD4O60885 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRD4O60885 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRD4O60885 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRD4O60885 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRD4O60885 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
BRD4O60885 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRD4O60885 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRD4O60885 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRD4O60885 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRD4O60885 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRD4O60885 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRD4O60885 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRD4O60885 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRD4O60885 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRD4O60885 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
BRD4O60885 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRD4O60885 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRD4O60885 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRD4O60885 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRD4O60885 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRD4O60885 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRD4O60885 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRD4O60885 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRD4O60885 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRD4O60885 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRD4O60885 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRD4O60885 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRD4O60885 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
BRD4O60885 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRD4O60885 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRD4O60885 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRD4O60885 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRD4O60885 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRD4O60885 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRD4O60885 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRD4O60885 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
BRD4O60885 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRD4O60885 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BRD4O60885 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRD4O60885 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRD4O60885 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRD4O60885 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRD4O60885 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRD4O60885 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRD4O60885 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRD4O60885 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRD4O60885 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRD4O60885 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRD4O60885 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRD4O60885 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
BRD4O60885 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms