Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF4O60810 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF4O60810 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF4O60810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms