Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK2O60296 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK2O60296 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAK2O60296 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAK2O60296 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms