Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2AO43736 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITM2AO43736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITM2AO43736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITM2AO43736 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms