Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3O43617 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC3O43617 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3O43617 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms