Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM6AO15550 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM6AO15550 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM6AO15550 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms