Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms