Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAPBPO15533 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAPBPO15533 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAPBPO15533 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAPBPO15533 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms