Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2DO15399 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GRIN2DO15399 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIN2DO15399 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2DO15399 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2DO15399 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2DO15399 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2DO15399 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2DO15399 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2DO15399 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2DO15399 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2DO15399 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2DO15399 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2DO15399 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2DO15399 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2DO15399 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2DO15399 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2DO15399 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2DO15399 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2DO15399 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2DO15399 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2DO15399 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2DO15399 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2DO15399 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2DO15399 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms