Protein–RNA interactions for Protein: O14613

CDC42EP2, Cdc42 effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP2O14613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42EP2O14613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP2O14613 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP2O14613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms