Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ASTN1O14525 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ASTN1O14525 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASTN1O14525 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms