Protein–RNA interactions for Protein: H8Y6P7

GCOM1, GRINL1A combined protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1H8Y6P7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GCOM1H8Y6P7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCOM1H8Y6P7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GCOM1H8Y6P7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GCOM1H8Y6P7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCOM1H8Y6P7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.6 ms