Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM25AB3EWG3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM25AB3EWG3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM25AB3EWG3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM25AB3EWG3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms