Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP29-1A8MX34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP29-1A8MX34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP29-1A8MX34 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms