Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN2A8MW95 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN2A8MW95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BECN2A8MW95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BECN2A8MW95 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 810.3 ms