Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRR3A8MPY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRR3A8MPY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms