Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJE1A6NN92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJE1A6NN92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJE1A6NN92 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms