Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HMX3A6NHT5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMX3A6NHT5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms