Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRAMEF22A3QJZ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRAMEF22A3QJZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms