Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S2A0A599 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCRBV5S2A0A599 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCRBV5S2A0A599 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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