Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YY10 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YY10 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0J9YY10 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0J9YY10 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms