Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.698e-7■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.49□□□□□ -1.058e-7■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.65□□□□□ -1.663e-47■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-37■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 322.1■■□□□ 1.138e-10■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 GNB2-212ENST00000470354 902 ntTSL 522.06■■□□□ 1.128e-10■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 MFGE8-212ENST00000559997 531 ntTSL 519.6■□□□□ 0.738e-10■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 514.93□□□□□ -0.028e-10■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.078e-10■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-10■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 310.12□□□□□ -0.798e-10■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 9.9
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PCBP1Q15365 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■□□□□ 9.9
PCBP1Q15365 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 PSAP-203ENST00000493143 576 ntTSL 213.49□□□□□ -0.255e-12■□□□□ 9.8
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PCBP1Q15365 KCNK4-203ENST00000453423 971 ntTSL 222.51■■□□□ 1.193e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-206ENST00000538846 814 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.193e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.173e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-208ENST00000539651 545 ntTSL 421.07■□□□□ 0.963e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 HMG20B-216ENST00000585900 741 ntTSL 320.24■□□□□ 0.837e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-209ENST00000541349 1450 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.663e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.283e-6■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.46e-21■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 EIF1B-202ENST00000462088 873 ntTSL 26.27□□□□□ -1.416e-21■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 EIF1B-204ENST00000488260 637 ntTSL 25.89□□□□□ -1.476e-21■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 CPE-203ENST00000480404 437 ntTSL 220.79■□□□□ 0.924e-7■□□□□ 9.8
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PCBP1Q15365 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 9.8
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PCBP1Q15365 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.296e-20■□□□□ 9.8
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PCBP1Q15365 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.86e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.936e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.016e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.096e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 58.16□□□□□ -1.16e-20■□□□□ 9.8
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PCBP1Q15365 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 37.61□□□□□ -1.196e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 27.4□□□□□ -1.236e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.276e-20■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 G6PC-202ENST00000585489 1097 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.513e-10■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-10■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 G6PC-203ENST00000588481 604 ntTSL 28.23□□□□□ -1.093e-10■□□□□ 9.8
PCBP1Q15365 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-19■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.76□□□□□ -1.812e-19■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 AL512328.1-201ENST00000412344 536 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.516e-64■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.92e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 215.52■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt10.58□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-13■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-13■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-13■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-13■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.722e-13■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 528.94■■■□□ 2.224e-7■□□□□ 9.7
PCBP1Q15365 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 327.96■■■□□ 2.074e-12■□□□□ 9.7
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