RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558029.5

MFGE8-206, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-206ENST00000558029 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.24■■■■■ 4.35
MFGE8-206ENST00000558029 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.49■■■■□ 3.59
MFGE8-206ENST00000558029 ABCC9O60706 1549 aa36.54■■■■□ 3.44
MFGE8-206ENST00000558029 NACADO15069 1562 aa35.28■■■■□ 3.24
MFGE8-206ENST00000558029 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
MFGE8-206ENST00000558029 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.18■■■■□ 3.22
MFGE8-206ENST00000558029 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
MFGE8-206ENST00000558029 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.12■■■■□ 3.21
MFGE8-206ENST00000558029 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.03■■■■□ 3.2
MFGE8-206ENST00000558029 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.41■■■■□ 3.1
MFGE8-206ENST00000558029 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.21■■■■□ 3.07
MFGE8-206ENST00000558029 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
MFGE8-206ENST00000558029 SCRIBQ14160 1630 aa34.11■■■■□ 3.05
MFGE8-206ENST00000558029 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.93■■■■□ 3.02
MFGE8-206ENST00000558029 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.59■■■□□ 2.97
MFGE8-206ENST00000558029 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
MFGE8-206ENST00000558029 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.1■■■□□ 2.89
MFGE8-206ENST00000558029 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.87■■■□□ 2.85
MFGE8-206ENST00000558029 SMARCA4P51532 1647 aa32.71■■■□□ 2.83
MFGE8-206ENST00000558029 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
MFGE8-206ENST00000558029 NCAPD3P42695 1498 aa32.6■■■□□ 2.81
MFGE8-206ENST00000558029 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.57■■■□□ 2.8
MFGE8-206ENST00000558029 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.52■■■□□ 2.8
MFGE8-206ENST00000558029 SMARCA2P51531 1590 aa32.51■■■□□ 2.79
MFGE8-206ENST00000558029 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.49■■■□□ 2.79
MFGE8-206ENST00000558029 HMGXB3Q12766 1538 aa32.38■■■□□ 2.77
MFGE8-206ENST00000558029 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
MFGE8-206ENST00000558029 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
MFGE8-206ENST00000558029 WIZO95785 1651 aa32.12■■■□□ 2.73
MFGE8-206ENST00000558029 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
MFGE8-206ENST00000558029 NESP48681 1621 aa31.66■■■□□ 2.66
MFGE8-206ENST00000558029 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.65■■■□□ 2.66
MFGE8-206ENST00000558029 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.62■■■□□ 2.65
MFGE8-206ENST00000558029 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.47■■■□□ 2.63
MFGE8-206ENST00000558029 ERCC6Q03468 1493 aa31.47■■■□□ 2.63
MFGE8-206ENST00000558029 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.45■■■□□ 2.63
MFGE8-206ENST00000558029 CFTRP13569 1480 aa31.45■■■□□ 2.62
MFGE8-206ENST00000558029 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
MFGE8-206ENST00000558029 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.26■■■□□ 2.6
MFGE8-206ENST00000558029 CUX2O14529 1486 aa31.23■■■□□ 2.59
MFGE8-206ENST00000558029 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.19■■■□□ 2.58
MFGE8-206ENST00000558029 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
MFGE8-206ENST00000558029 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.12■■■□□ 2.57
MFGE8-206ENST00000558029 PRDM2Q13029 1718 aa31.11■■■□□ 2.57
MFGE8-206ENST00000558029 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.08■■■□□ 2.57
MFGE8-206ENST00000558029 WDR62O43379 1518 aa31.01■■■□□ 2.55
MFGE8-206ENST00000558029 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
MFGE8-206ENST00000558029 ABCC8Q09428 1581 aa30.77■■■□□ 2.52
MFGE8-206ENST00000558029 TOPBP1Q92547 1522 aa30.71■■■□□ 2.51
MFGE8-206ENST00000558029 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.66■■■□□ 2.5
MFGE8-206ENST00000558029 IFT140Q96RY7 1462 aa30.51■■■□□ 2.48
MFGE8-206ENST00000558029 CUX1P39880 1505 aa30.5■■■□□ 2.47
MFGE8-206ENST00000558029 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
MFGE8-206ENST00000558029 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
MFGE8-206ENST00000558029 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.36■■■□□ 2.45
MFGE8-206ENST00000558029 SOGA1O94964 1423 aa30.34■■■□□ 2.45
MFGE8-206ENST00000558029 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
MFGE8-206ENST00000558029 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
MFGE8-206ENST00000558029 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.29■■■□□ 2.44
MFGE8-206ENST00000558029 TOP2BQ02880 1626 aa30.26■■■□□ 2.44
MFGE8-206ENST00000558029 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.25■■■□□ 2.43
MFGE8-206ENST00000558029 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.24■■■□□ 2.43
MFGE8-206ENST00000558029 SYNJ1O43426 1573 aa30.21■■■□□ 2.43
MFGE8-206ENST00000558029 WDR97A6NE52 1622 aa30.18■■■□□ 2.42
MFGE8-206ENST00000558029 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
MFGE8-206ENST00000558029 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.423e-8■■■■■ 35.9
MFGE8-206ENST00000558029 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
MFGE8-206ENST00000558029 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-206ENST00000558029 GRIN2BQ13224 1484 aa29.98■■■□□ 2.39
MFGE8-206ENST00000558029 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.98■■■□□ 2.39
MFGE8-206ENST00000558029 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.96■■■□□ 2.39
MFGE8-206ENST00000558029 OSCARQ8IYS5 282 aa29.96■■■□□ 2.39
MFGE8-206ENST00000558029 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
MFGE8-206ENST00000558029 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.87■■■□□ 2.37
MFGE8-206ENST00000558029 PBRM1Q86U86 1689 aa29.84■■■□□ 2.37
MFGE8-206ENST00000558029 SYNJ2O15056 1496 aa29.77■■■□□ 2.36
MFGE8-206ENST00000558029 CHD1O14646 1710 aa29.76■■■□□ 2.36
MFGE8-206ENST00000558029 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.76■■■□□ 2.36
MFGE8-206ENST00000558029 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
MFGE8-206ENST00000558029 FBLN2P98095 1184 aa29.73■■■□□ 2.35
MFGE8-206ENST00000558029 KIF27Q86VH2 1401 aa29.71■■■□□ 2.35
MFGE8-206ENST00000558029 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.66■■■□□ 2.34
MFGE8-206ENST00000558029 ADAMTS12P58397 1594 aa29.64■■■□□ 2.34
MFGE8-206ENST00000558029 IGF1RP08069 1367 aa29.64■■■□□ 2.33
MFGE8-206ENST00000558029 TRIM41Q8WV44 630 aa29.63■■■□□ 2.33
MFGE8-206ENST00000558029 GRIN2AQ12879 1464 aa29.57■■■□□ 2.32
MFGE8-206ENST00000558029 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.54■■■□□ 2.32
MFGE8-206ENST00000558029 NUP160Q12769 1436 aa29.49■■■□□ 2.31
MFGE8-206ENST00000558029 CUL7Q14999 1698 aa29.46■■■□□ 2.31
MFGE8-206ENST00000558029 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.42■■■□□ 2.3
MFGE8-206ENST00000558029 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.41■■■□□ 2.3
MFGE8-206ENST00000558029 ARHGEF11O15085 1522 aa29.41■■■□□ 2.3
MFGE8-206ENST00000558029 CEP170Q5SW79 1584 aa29.4■■■□□ 2.3
MFGE8-206ENST00000558029 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.38■■■□□ 2.29
MFGE8-206ENST00000558029 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.38■■■□□ 2.29
MFGE8-206ENST00000558029 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.38■■■□□ 2.29
MFGE8-206ENST00000558029 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.36■■■□□ 2.29
MFGE8-206ENST00000558029 SHROOM2Q13796 1616 aa29.24■■■□□ 2.27
MFGE8-206ENST00000558029 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
MFGE8-206ENST00000558029 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms