RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557944.1

MFGE8-204, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 435 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-204ENST00000557944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.84■■■■■ 5.09
MFGE8-204ENST00000557944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.4■■■■■ 4.22
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC9O60706 1549 aa39.99■■■■□ 3.99
MFGE8-204ENST00000557944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
MFGE8-204ENST00000557944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.91■■■■□ 3.82
MFGE8-204ENST00000557944 NACADO15069 1562 aa38.85■■■■□ 3.81
MFGE8-204ENST00000557944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.84■■■■□ 3.81
MFGE8-204ENST00000557944 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.83■■■■□ 3.81
MFGE8-204ENST00000557944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.75■■■■□ 3.79
MFGE8-204ENST00000557944 SCRIBQ14160 1630 aa37.76■■■■□ 3.63
MFGE8-204ENST00000557944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.69■■■■□ 3.62
MFGE8-204ENST00000557944 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.48■■■■□ 3.59
MFGE8-204ENST00000557944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.59
MFGE8-204ENST00000557944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.3■■■■□ 3.56
MFGE8-204ENST00000557944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
MFGE8-204ENST00000557944 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.37■■■■□ 3.41
MFGE8-204ENST00000557944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
MFGE8-204ENST00000557944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.2■■■■□ 3.39
MFGE8-204ENST00000557944 SMARCA4P51532 1647 aa36.19■■■■□ 3.38
MFGE8-204ENST00000557944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.18■■■■□ 3.38
MFGE8-204ENST00000557944 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.06■■■■□ 3.36
MFGE8-204ENST00000557944 SMARCA2P51531 1590 aa35.93■■■■□ 3.34
MFGE8-204ENST00000557944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.92■■■■□ 3.34
MFGE8-204ENST00000557944 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.89■■■■□ 3.34
MFGE8-204ENST00000557944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
MFGE8-204ENST00000557944 NCAPD3P42695 1498 aa35.86■■■■□ 3.33
MFGE8-204ENST00000557944 HMGXB3Q12766 1538 aa35.7■■■■□ 3.31
MFGE8-204ENST00000557944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
MFGE8-204ENST00000557944 WIZO95785 1651 aa35.65■■■■□ 3.3
MFGE8-204ENST00000557944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
MFGE8-204ENST00000557944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
MFGE8-204ENST00000557944 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.96■■■■□ 3.19
MFGE8-204ENST00000557944 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.84■■■■□ 3.17
MFGE8-204ENST00000557944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.79■■■■□ 3.16
MFGE8-204ENST00000557944 NESP48681 1621 aa34.73■■■■□ 3.15
MFGE8-204ENST00000557944 CFTRP13569 1480 aa34.72■■■■□ 3.15
MFGE8-204ENST00000557944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.6■■■■□ 3.13
MFGE8-204ENST00000557944 ERCC6Q03468 1493 aa34.49■■■■□ 3.11
MFGE8-204ENST00000557944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.4■■■■□ 3.1
MFGE8-204ENST00000557944 PRDM2Q13029 1718 aa34.38■■■■□ 3.09
MFGE8-204ENST00000557944 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.33■■■■□ 3.09
MFGE8-204ENST00000557944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.28■■■■□ 3.08
MFGE8-204ENST00000557944 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.17■■■■□ 3.06
MFGE8-204ENST00000557944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
MFGE8-204ENST00000557944 WDR62O43379 1518 aa34.02■■■■□ 3.04
MFGE8-204ENST00000557944 ABCC8Q09428 1581 aa34.01■■■■□ 3.03
MFGE8-204ENST00000557944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
MFGE8-204ENST00000557944 CUX2O14529 1486 aa33.95■■■■□ 3.03
MFGE8-204ENST00000557944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.91■■■■□ 3.02
MFGE8-204ENST00000557944 TOPBP1Q92547 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
MFGE8-204ENST00000557944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.84■■■■□ 3.01
MFGE8-204ENST00000557944 CUX1P39880 1505 aa33.8■■■■□ 3
MFGE8-204ENST00000557944 TOP2BQ02880 1626 aa33.68■■■□□ 2.98
MFGE8-204ENST00000557944 SYNJ1O43426 1573 aa33.64■■■□□ 2.98
MFGE8-204ENST00000557944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
MFGE8-204ENST00000557944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.64■■■□□ 2.98
MFGE8-204ENST00000557944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.63■■■□□ 2.97
MFGE8-204ENST00000557944 IFT140Q96RY7 1462 aa33.61■■■□□ 2.97
MFGE8-204ENST00000557944 SOGA1O94964 1423 aa33.54■■■□□ 2.96
MFGE8-204ENST00000557944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
MFGE8-204ENST00000557944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.45■■■□□ 2.95
MFGE8-204ENST00000557944 TRIM41Q8WV44 630 aa33.41■■■□□ 2.94
MFGE8-204ENST00000557944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.36■■■□□ 2.93
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
MFGE8-204ENST00000557944 WDR97A6NE52 1622 aa33.31■■■□□ 2.92
MFGE8-204ENST00000557944 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.29■■■□□ 2.92
MFGE8-204ENST00000557944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
MFGE8-204ENST00000557944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
MFGE8-204ENST00000557944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
MFGE8-204ENST00000557944 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.16■■■□□ 2.9
MFGE8-204ENST00000557944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.13■■■□□ 2.89
MFGE8-204ENST00000557944 KIF27Q86VH2 1401 aa33.12■■■□□ 2.89
MFGE8-204ENST00000557944 GRIN2BQ13224 1484 aa33.11■■■□□ 2.89
MFGE8-204ENST00000557944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.98■■■□□ 2.87
MFGE8-204ENST00000557944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
MFGE8-204ENST00000557944 PBRM1Q86U86 1689 aa32.95■■■□□ 2.87
MFGE8-204ENST00000557944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.94■■■□□ 2.86
MFGE8-204ENST00000557944 IGF1RP08069 1367 aa32.89■■■□□ 2.86
MFGE8-204ENST00000557944 EEA1Q15075 1411 aa32.87■■■□□ 2.85
MFGE8-204ENST00000557944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.85■■■□□ 2.85
MFGE8-204ENST00000557944 SYNJ2O15056 1496 aa32.83■■■□□ 2.85
MFGE8-204ENST00000557944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.83■■■□□ 2.85
MFGE8-204ENST00000557944 ADAMTS12P58397 1594 aa32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-204ENST00000557944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
MFGE8-204ENST00000557944 CUL7Q14999 1698 aa32.75■■■□□ 2.83
MFGE8-204ENST00000557944 FBLN2P98095 1184 aa32.75■■■□□ 2.83
MFGE8-204ENST00000557944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.71■■■□□ 2.83
MFGE8-204ENST00000557944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.7■■■□□ 2.83
MFGE8-204ENST00000557944 OSCARQ8IYS5 282 aa32.66■■■□□ 2.82
MFGE8-204ENST00000557944 GRIN2AQ12879 1464 aa32.66■■■□□ 2.82
MFGE8-204ENST00000557944 CHD1O14646 1710 aa32.64■■■□□ 2.82
MFGE8-204ENST00000557944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
MFGE8-204ENST00000557944 PRXQ9BXM0 1461 aa32.59■■■□□ 2.81
MFGE8-204ENST00000557944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.58■■■□□ 2.81
MFGE8-204ENST00000557944 NUP160Q12769 1436 aa32.51■■■□□ 2.79
MFGE8-204ENST00000557944 CEP170Q5SW79 1584 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-204ENST00000557944 KIF21BO75037 1637 aa32.4■■■□□ 2.78
MFGE8-204ENST00000557944 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.38■■■□□ 2.77
MFGE8-204ENST00000557944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.34■■■□□ 2.77
MFGE8-204ENST00000557944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms