RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575009.5

SRRM2-222, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 5

Gene SRRM2, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-222	ENST00000575009	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		64.08	■■■■■ 7.85
SRRM2-222	ENST00000575009	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		57.06	■■■■■ 6.72
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC9	O60706	1549 aa		56.12	■■■■■ 6.57
SRRM2-222	ENST00000575009	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		53.78	■■■■■ 6.2
SRRM2-222	ENST00000575009	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		53.65	■■■■■ 6.18
SRRM2-222	ENST00000575009	NACAD	O15069	1562 aa		53.65	■■■■■ 6.18
SRRM2-222	ENST00000575009	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	53.33	■■■■■ 6.13
SRRM2-222	ENST00000575009	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		53.19	■■■■■ 6.11
SRRM2-222	ENST00000575009	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		52.91	■■■■■ 6.06
SRRM2-222	ENST00000575009	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		52.74	■■■■■ 6.03
SRRM2-222	ENST00000575009	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	52.39	■■■■■ 5.98
SRRM2-222	ENST00000575009	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		52.26	■■■■■ 5.96
SRRM2-222	ENST00000575009	SCRIB	Q14160	1630 aa		52.15	■■■■■ 5.94
SRRM2-222	ENST00000575009	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		51.7	■■■■■ 5.87
SRRM2-222	ENST00000575009	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		51.48	■■■■■ 5.83
SRRM2-222	ENST00000575009	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	50.86	■■■■■ 5.73
SRRM2-222	ENST00000575009	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		50.73	■■■■■ 5.71
SRRM2-222	ENST00000575009	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		50.38	■■■■■ 5.66
SRRM2-222	ENST00000575009	SMARCA4	P51532	1647 aa		49.81	■■■■■ 5.56
SRRM2-222	ENST00000575009	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	49.65	■■■■■ 5.54
SRRM2-222	ENST00000575009	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		49.55	■■■■■ 5.52
SRRM2-222	ENST00000575009	NCAPD3	P42695	1498 aa		49.5	■■■■■ 5.51
SRRM2-222	ENST00000575009	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		49.44	■■■■■ 5.5
SRRM2-222	ENST00000575009	SMARCA2	P51531	1590 aa		49.43	■■■■■ 5.5
SRRM2-222	ENST00000575009	HMGXB3	Q12766	1538 aa		49.26	■■■■■ 5.48
SRRM2-222	ENST00000575009	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		49.25	■■■■■ 5.47
SRRM2-222	ENST00000575009	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	49.12	■■■■■ 5.45
SRRM2-222	ENST00000575009	WIZ	O95785	1651 aa		48.94	■■■■■ 5.42
SRRM2-222	ENST00000575009	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	48.75	■■■■■ 5.39
SRRM2-222	ENST00000575009	NES	P48681	1621 aa		48.52	■■■■■ 5.36
SRRM2-222	ENST00000575009	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	48.32	■■■■■ 5.33
SRRM2-222	ENST00000575009	ERCC6	Q03468	1493 aa		48.31	■■■■■ 5.32
SRRM2-222	ENST00000575009	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		48.26	■■■■■ 5.32
SRRM2-222	ENST00000575009	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		48.05	■■■■■ 5.28
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		47.97	■■■■■ 5.27
SRRM2-222	ENST00000575009	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		47.89	■■■■■ 5.26
SRRM2-222	ENST00000575009	CUX2	O14529	1486 aa		47.82	■■■■■ 5.25
SRRM2-222	ENST00000575009	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	47.81	■■■■■ 5.24
SRRM2-222	ENST00000575009	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		47.77	■■■■■ 5.24
SRRM2-222	ENST00000575009	CFTR	P13569	1480 aa		47.74	■■■■■ 5.23
SRRM2-222	ENST00000575009	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		47.55	■■■■■ 5.2
SRRM2-222	ENST00000575009	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		47.5	■■■■■ 5.19
SRRM2-222	ENST00000575009	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		47.48	■■■■■ 5.19
SRRM2-222	ENST00000575009	PRDM2	Q13029	1718 aa		47.46	■■■■■ 5.19
SRRM2-222	ENST00000575009	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	47.39	■■■■■ 5.18
SRRM2-222	ENST00000575009	WDR62	O43379	1518 aa		47.34	■■■■■ 5.17
SRRM2-222	ENST00000575009	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	47.14	■■■■■ 5.14
SRRM2-222	ENST00000575009	TOPBP1	Q92547	1522 aa		46.79	■■■■■ 5.08
SRRM2-222	ENST00000575009	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		46.7	■■■■■ 5.07
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC8	Q09428	1581 aa		46.64	■■■■■ 5.06
SRRM2-222	ENST00000575009	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		46.61	■■■■■ 5.05
SRRM2-222	ENST00000575009	IFT140	Q96RY7	1462 aa		46.48	■■■■■ 5.03
SRRM2-222	ENST00000575009	CUX1	P39880	1505 aa		46.39	■■■■■ 5.02
SRRM2-222	ENST00000575009	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	46.39	■■■■■ 5.02
SRRM2-222	ENST00000575009	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	46.38	■■■■■ 5.01
SRRM2-222	ENST00000575009	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	46.32	■■■■■ 5
SRRM2-222	ENST00000575009	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		46.25	■■■■■ 4.99
SRRM2-222	ENST00000575009	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		46.22	■■■■■ 4.99
SRRM2-222	ENST00000575009	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	46.21	■■■■■ 4.99
SRRM2-222	ENST00000575009	SOGA1	O94964	1423 aa		46.14	■■■■■ 4.98
SRRM2-222	ENST00000575009	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	46.08	■■■■■ 4.97	6e-9	■■■■□ 24.4
SRRM2-222	ENST00000575009	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	45.96	■■■■■ 4.95
SRRM2-222	ENST00000575009	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	45.94	■■■■■ 4.95
SRRM2-222	ENST00000575009	SYNJ1	O43426	1573 aa		45.94	■■■■■ 4.94
SRRM2-222	ENST00000575009	WDR97	A6NE52	1622 aa		45.92	■■■■■ 4.94
SRRM2-222	ENST00000575009	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		45.92	■■■■■ 4.94
SRRM2-222	ENST00000575009	TOP2B	Q02880	1626 aa		45.89	■■■■■ 4.94
SRRM2-222	ENST00000575009	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		45.79	■■■■■ 4.92
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		45.73	■■■■■ 4.91
SRRM2-222	ENST00000575009	CHD1	O14646	1710 aa		45.71	■■■■■ 4.91
SRRM2-222	ENST00000575009	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		45.65	■■■■■ 4.9
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		45.63	■■■■■ 4.9
SRRM2-222	ENST00000575009	PBRM1	Q86U86	1689 aa		45.63	■■■■■ 4.89
SRRM2-222	ENST00000575009	GRIN2B	Q13224	1484 aa		45.61	■■■■■ 4.89
SRRM2-222	ENST00000575009	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		45.61	■■■■■ 4.89
SRRM2-222	ENST00000575009	FBLN2	P98095	1184 aa		45.55	■■■■■ 4.88
SRRM2-222	ENST00000575009	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	45.5	■■■■■ 4.87
SRRM2-222	ENST00000575009	SYNJ2	O15056	1496 aa		45.35	■■■■■ 4.85
SRRM2-222	ENST00000575009	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	45.33	■■■■■ 4.85
SRRM2-222	ENST00000575009	ADAMTS12	P58397	1594 aa		45.22	■■■■■ 4.83
SRRM2-222	ENST00000575009	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		45.22	■■■■■ 4.83
SRRM2-222	ENST00000575009	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		45.22	■■■■■ 4.83
SRRM2-222	ENST00000575009	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		45.22	■■■■■ 4.83
SRRM2-222	ENST00000575009	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		45.16	■■■■■ 4.82
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGEF11	O15085	1522 aa		45.15	■■■■■ 4.82
SRRM2-222	ENST00000575009	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		45.13	■■■■■ 4.82
SRRM2-222	ENST00000575009	TRIM41	Q8WV44	630 aa		45.1	■■■■■ 4.81
SRRM2-222	ENST00000575009	GRIN2A	Q12879	1464 aa		45.06	■■■■■ 4.8
SRRM2-222	ENST00000575009	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		45.05	■■■■■ 4.8
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF27	Q86VH2	1401 aa		44.96	■■■■■ 4.79
SRRM2-222	ENST00000575009	CEP170	Q5SW79	1584 aa		44.91	■■■■■ 4.78
SRRM2-222	ENST00000575009	NUP160	Q12769	1436 aa		44.85	■■■■■ 4.77
SRRM2-222	ENST00000575009	IGF1R	P08069	1367 aa		44.83	■■■■■ 4.77
SRRM2-222	ENST00000575009	ARAP1	Q96P48	1450 aa		44.79	■■■■■ 4.76
SRRM2-222	ENST00000575009	CUL7	Q14999	1698 aa		44.75	■■■■■ 4.75
SRRM2-222	ENST00000575009	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		44.71	■■■■■ 4.75
SRRM2-222	ENST00000575009	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		44.65	■■■■■ 4.74
SRRM2-222	ENST00000575009	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.59	■■■■■ 4.73
SRRM2-222	ENST00000575009	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.57	■■■■■ 4.73
SRRM2-222	ENST00000575009	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.56	■■■■■ 4.72

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