Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCSO14618 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCSO14618 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCSO14618 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCSO14618 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms