RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538716.6

TMUB2-204, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-204ENST00000538716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.66■■■■□ 3.14
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.46■■■□□ 2.31
TMUB2-204ENST00000538716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TMUB2-204ENST00000538716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.32■■■□□ 2.28
TMUB2-204ENST00000538716 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TMUB2-204ENST00000538716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.63■■■□□ 2.17
TMUB2-204ENST00000538716 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.41■■■□□ 2.14
TMUB2-204ENST00000538716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.26■■■□□ 2.11
TMUB2-204ENST00000538716 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.25■■■□□ 2.11
TMUB2-204ENST00000538716 HRCP23327 699 aa27.91■■■□□ 2.06
TMUB2-204ENST00000538716 ABCC9O60706 1549 aa27.74■■■□□ 2.03
TMUB2-204ENST00000538716 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.57■■■□□ 2
TMUB2-204ENST00000538716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TMUB2-204ENST00000538716 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.4■■□□□ 1.98
TMUB2-204ENST00000538716 SCRIBQ14160 1630 aa27.38■■□□□ 1.97
TMUB2-204ENST00000538716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.26■■□□□ 1.95
TMUB2-204ENST00000538716 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TMUB2-204ENST00000538716 NACADO15069 1562 aa27.19■■□□□ 1.94
TMUB2-204ENST00000538716 TRIM41Q8WV44 630 aa27.05■■□□□ 1.92
TMUB2-204ENST00000538716 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TMUB2-204ENST00000538716 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.88■■□□□ 1.89
TMUB2-204ENST00000538716 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.86■■□□□ 1.89
TMUB2-204ENST00000538716 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TMUB2-204ENST00000538716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TMUB2-204ENST00000538716 WIZO95785 1651 aa26.68■■□□□ 1.86
TMUB2-204ENST00000538716 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TMUB2-204ENST00000538716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TMUB2-204ENST00000538716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TMUB2-204ENST00000538716 SMARCA4P51532 1647 aa26.32■■□□□ 1.8
TMUB2-204ENST00000538716 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.24■■□□□ 1.79
TMUB2-204ENST00000538716 SMARCA2P51531 1590 aa26.23■■□□□ 1.79
TMUB2-204ENST00000538716 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.2■■□□□ 1.79
TMUB2-204ENST00000538716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
TMUB2-204ENST00000538716 EEA1Q15075 1411 aa26.13■■□□□ 1.77
TMUB2-204ENST00000538716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.1■■□□□ 1.77
TMUB2-204ENST00000538716 ABCC8Q09428 1581 aa26.1■■□□□ 1.77
TMUB2-204ENST00000538716 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.06■■□□□ 1.76
TMUB2-204ENST00000538716 CEP162Q5TB80 1403 aa25.99■■□□□ 1.75
TMUB2-204ENST00000538716 SOGA1O94964 1423 aa25.95■■□□□ 1.74
TMUB2-204ENST00000538716 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.94■■□□□ 1.74
TMUB2-204ENST00000538716 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.91■■□□□ 1.74
TMUB2-204ENST00000538716 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TMUB2-204ENST00000538716 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TMUB2-204ENST00000538716 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.85■■□□□ 1.73
TMUB2-204ENST00000538716 GOLGA3Q08378 1498 aa25.83■■□□□ 1.72
TMUB2-204ENST00000538716 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.77■■□□□ 1.72
TMUB2-204ENST00000538716 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TMUB2-204ENST00000538716 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TMUB2-204ENST00000538716 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TMUB2-204ENST00000538716 KIF21BO75037 1637 aa25.68■■□□□ 1.7
TMUB2-204ENST00000538716 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.68■■□□□ 1.7
TMUB2-204ENST00000538716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.693e-6■■■□□ 16
TMUB2-204ENST00000538716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.61■■□□□ 1.69
TMUB2-204ENST00000538716 SYNJ1O43426 1573 aa25.6■■□□□ 1.69
TMUB2-204ENST00000538716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TMUB2-204ENST00000538716 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TMUB2-204ENST00000538716 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
TMUB2-204ENST00000538716 CLIP1P30622 1438 aa25.48■■□□□ 1.67
TMUB2-204ENST00000538716 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TMUB2-204ENST00000538716 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.45■■□□□ 1.66
TMUB2-204ENST00000538716 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TMUB2-204ENST00000538716 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
TMUB2-204ENST00000538716 NEUROD1Q13562 356 aa25.37■■□□□ 1.65
TMUB2-204ENST00000538716 TOP2BQ02880 1626 aa25.37■■□□□ 1.65
TMUB2-204ENST00000538716 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.33■■□□□ 1.65
TMUB2-204ENST00000538716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
TMUB2-204ENST00000538716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
TMUB2-204ENST00000538716 APLP2Q06481 763 aa25.24■■□□□ 1.63
TMUB2-204ENST00000538716 PRXQ9BXM0 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
TMUB2-204ENST00000538716 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TMUB2-204ENST00000538716 HMGXB3Q12766 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
TMUB2-204ENST00000538716 NCAPD3P42695 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
TMUB2-204ENST00000538716 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.13■■□□□ 1.61
TMUB2-204ENST00000538716 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.13■■□□□ 1.61
TMUB2-204ENST00000538716 ARAP1Q96P48 1450 aa25.06■■□□□ 1.6
TMUB2-204ENST00000538716 CUX1P39880 1505 aa25.02■■□□□ 1.6
TMUB2-204ENST00000538716 KIF27Q86VH2 1401 aa25■■□□□ 1.59
TMUB2-204ENST00000538716 CFTRP13569 1480 aa24.97■■□□□ 1.59
TMUB2-204ENST00000538716 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TMUB2-204ENST00000538716 MIER1Q8N108 512 aa24.93■■□□□ 1.58
TMUB2-204ENST00000538716 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMUB2-204ENST00000538716 CUX2O14529 1486 aa24.89■■□□□ 1.58
TMUB2-204ENST00000538716 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TMUB2-204ENST00000538716 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TMUB2-204ENST00000538716 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.81■■□□□ 1.56
TMUB2-204ENST00000538716 PRDM2Q13029 1718 aa24.76■■□□□ 1.55
TMUB2-204ENST00000538716 MAP3K1Q13233 1512 aa24.76■■□□□ 1.55
TMUB2-204ENST00000538716 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.74■■□□□ 1.55
TMUB2-204ENST00000538716 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TMUB2-204ENST00000538716 IGF1RP08069 1367 aa24.69■■□□□ 1.54
TMUB2-204ENST00000538716 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.62■■□□□ 1.53
TMUB2-204ENST00000538716 TIAM1Q13009 1591 aa24.6■■□□□ 1.53
TMUB2-204ENST00000538716 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.58■■□□□ 1.53
TMUB2-204ENST00000538716 MYT1Q01538 1121 aa24.55■■□□□ 1.52
TMUB2-204ENST00000538716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.52■■□□□ 1.52
TMUB2-204ENST00000538716 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
TMUB2-204ENST00000538716 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.51■■□□□ 1.51
TMUB2-204ENST00000538716 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.5■■□□□ 1.51
TMUB2-204ENST00000538716 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.46■■□□□ 1.51
TMUB2-204ENST00000538716 MAPKBP1O60336 1514 aa24.46■■□□□ 1.51
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