Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
U3KQE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
U3KQE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
U3KQE9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
U3KQE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
U3KQE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
U3KQE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
U3KQE9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
U3KQE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
U3KQE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
U3KQE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
U3KQE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
U3KQE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
U3KQE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
U3KQE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
U3KQE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
U3KQE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
U3KQE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
U3KQE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
U3KQE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
U3KQE9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
U3KQE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms