Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.91■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms