Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIAS3Q9Y6X2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIAS3Q9Y6X2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIAS3Q9Y6X2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms