Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y623

MYH4, Myosin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH4Q9Y623 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH4Q9Y623 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MYH4Q9Y623 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYH4Q9Y623 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYH4Q9Y623 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH4Q9Y623 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms