Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPRBQ9Y5M8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRPRBQ9Y5M8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms