Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXBP1Q9Y5B6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXBP1Q9Y5B6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PAXBP1Q9Y5B6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAXBP1Q9Y5B6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms