Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKP3Q9Y446 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKP3Q9Y446 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKP3Q9Y446 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKP3Q9Y446 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms