Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIT1Q9Y3P8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIT1Q9Y3P8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIT1Q9Y3P8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIT1Q9Y3P8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms