Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM2Q9Y333 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM2Q9Y333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM2Q9Y333 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM2Q9Y333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms