Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
THSD7AQ9UPZ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
THSD7AQ9UPZ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
THSD7AQ9UPZ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
THSD7AQ9UPZ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
THSD7AQ9UPZ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
THSD7AQ9UPZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms