Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SORCS3Q9UPU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORCS3Q9UPU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SORCS3Q9UPU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SORCS3Q9UPU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms