Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNPO2Q9UMS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNPO2Q9UMS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNPO2Q9UMS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNPO2Q9UMS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNPO2Q9UMS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms