Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BARX2Q9UMQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BARX2Q9UMQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BARX2Q9UMQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARX2Q9UMQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARX2Q9UMQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms