Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCTS1Q9ULC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTS1Q9ULC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCTS1Q9ULC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms