Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH7Q9ULB5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH7Q9ULB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH7Q9ULB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms