Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
STAG3Q9UJ98 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
STAG3Q9UJ98 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STAG3Q9UJ98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
STAG3Q9UJ98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
STAG3Q9UJ98 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STAG3Q9UJ98 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
STAG3Q9UJ98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
STAG3Q9UJ98 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms