Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTSFQ9UBX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSFQ9UBX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSFQ9UBX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms