Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBD2Q9UBB5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD2Q9UBB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD2Q9UBB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms