Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
REREQ9P2R6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
REREQ9P2R6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
REREQ9P2R6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
REREQ9P2R6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
REREQ9P2R6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
REREQ9P2R6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
REREQ9P2R6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
REREQ9P2R6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
REREQ9P2R6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
REREQ9P2R6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms