Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC59Q9P031 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC59Q9P031 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC59Q9P031 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms