Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NINJ2Q9NZG7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINJ2Q9NZG7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NINJ2Q9NZG7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NINJ2Q9NZG7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 650.9 ms