Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRMT1Q9NXH9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TRMT1Q9NXH9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRMT1Q9NXH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRMT1Q9NXH9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms